Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms