Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms