Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms