Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO4P61968 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO4P61968 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO4P61968 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO4P61968 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO4P61968 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO4P61968 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO4P61968 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO4P61968 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO4P61968 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO4P61968 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO4P61968 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO4P61968 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO4P61968 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO4P61968 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO4P61968 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO4P61968 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO4P61968 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO4P61968 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO4P61968 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO4P61968 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO4P61968 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO4P61968 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO4P61968 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO4P61968 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO4P61968 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO4P61968 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO4P61968 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO4P61968 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO4P61968 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO4P61968 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO4P61968 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO4P61968 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO4P61968 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO4P61968 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO4P61968 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO4P61968 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO4P61968 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO4P61968 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO4P61968 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO4P61968 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO4P61968 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO4P61968 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO4P61968 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO4P61968 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO4P61968 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO4P61968 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO4P61968 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO4P61968 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMO4P61968 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMO4P61968 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMO4P61968 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMO4P61968 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMO4P61968 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMO4P61968 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMO4P61968 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMO4P61968 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMO4P61968 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMO4P61968 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMO4P61968 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO4P61968 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO4P61968 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO4P61968 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO4P61968 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO4P61968 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO4P61968 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO4P61968 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO4P61968 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO4P61968 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO4P61968 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO4P61968 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO4P61968 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO4P61968 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO4P61968 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO4P61968 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO4P61968 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO4P61968 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO4P61968 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO4P61968 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO4P61968 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO4P61968 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO4P61968 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO4P61968 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO4P61968 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO4P61968 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO4P61968 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms