Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LBX1P52954 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LBX1P52954 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LBX1P52954 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LBX1P52954 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LBX1P52954 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LBX1P52954 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LBX1P52954 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LBX1P52954 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LBX1P52954 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LBX1P52954 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LBX1P52954 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LBX1P52954 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LBX1P52954 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LBX1P52954 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LBX1P52954 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LBX1P52954 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LBX1P52954 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LBX1P52954 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LBX1P52954 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LBX1P52954 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LBX1P52954 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LBX1P52954 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LBX1P52954 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LBX1P52954 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LBX1P52954 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LBX1P52954 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LBX1P52954 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LBX1P52954 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LBX1P52954 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LBX1P52954 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LBX1P52954 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LBX1P52954 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LBX1P52954 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LBX1P52954 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LBX1P52954 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LBX1P52954 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LBX1P52954 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LBX1P52954 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LBX1P52954 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LBX1P52954 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LBX1P52954 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LBX1P52954 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LBX1P52954 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LBX1P52954 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LBX1P52954 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LBX1P52954 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LBX1P52954 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LBX1P52954 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LBX1P52954 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LBX1P52954 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LBX1P52954 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LBX1P52954 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LBX1P52954 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LBX1P52954 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LBX1P52954 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LBX1P52954 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LBX1P52954 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LBX1P52954 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LBX1P52954 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LBX1P52954 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LBX1P52954 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LBX1P52954 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LBX1P52954 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LBX1P52954 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LBX1P52954 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LBX1P52954 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LBX1P52954 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LBX1P52954 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LBX1P52954 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LBX1P52954 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LBX1P52954 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LBX1P52954 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LBX1P52954 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LBX1P52954 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LBX1P52954 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LBX1P52954 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LBX1P52954 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LBX1P52954 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LBX1P52954 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LBX1P52954 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LBX1P52954 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LBX1P52954 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LBX1P52954 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LBX1P52954 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LBX1P52954 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LBX1P52954 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LBX1P52954 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LBX1P52954 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LBX1P52954 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LBX1P52954 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LBX1P52954 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LBX1P52954 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LBX1P52954 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LBX1P52954 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LBX1P52954 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LBX1P52954 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LBX1P52954 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LBX1P52954 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LBX1P52954 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms