Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPFP49454 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPFP49454 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPFP49454 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPFP49454 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPFP49454 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPFP49454 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPFP49454 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPFP49454 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPFP49454 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPFP49454 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPFP49454 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPFP49454 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPFP49454 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPFP49454 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPFP49454 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPFP49454 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPFP49454 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CENPFP49454 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CENPFP49454 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CENPFP49454 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CENPFP49454 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPFP49454 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPFP49454 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPFP49454 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPFP49454 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPFP49454 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPFP49454 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPFP49454 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPFP49454 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPFP49454 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPFP49454 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPFP49454 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPFP49454 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPFP49454 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPFP49454 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPFP49454 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPFP49454 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPFP49454 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPFP49454 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPFP49454 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPFP49454 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPFP49454 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPFP49454 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPFP49454 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPFP49454 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPFP49454 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPFP49454 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPFP49454 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPFP49454 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPFP49454 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPFP49454 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPFP49454 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPFP49454 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPFP49454 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPFP49454 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPFP49454 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPFP49454 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPFP49454 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPFP49454 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPFP49454 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPFP49454 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPFP49454 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPFP49454 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPFP49454 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPFP49454 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPFP49454 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPFP49454 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPFP49454 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPFP49454 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPFP49454 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPFP49454 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPFP49454 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPFP49454 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPFP49454 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPFP49454 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPFP49454 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPFP49454 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPFP49454 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPFP49454 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPFP49454 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPFP49454 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPFP49454 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPFP49454 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPFP49454 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPFP49454 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPFP49454 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPFP49454 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPFP49454 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPFP49454 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPFP49454 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPFP49454 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPFP49454 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPFP49454 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPFP49454 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPFP49454 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPFP49454 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPFP49454 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPFP49454 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPFP49454 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms