Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECI1P42126 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECI1P42126 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECI1P42126 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECI1P42126 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECI1P42126 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECI1P42126 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECI1P42126 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ECI1P42126 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ECI1P42126 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECI1P42126 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECI1P42126 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECI1P42126 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECI1P42126 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECI1P42126 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECI1P42126 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECI1P42126 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECI1P42126 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECI1P42126 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECI1P42126 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECI1P42126 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECI1P42126 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ECI1P42126 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECI1P42126 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECI1P42126 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ECI1P42126 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ECI1P42126 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECI1P42126 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms