Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MLH1P40692 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MLH1P40692 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MLH1P40692 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MLH1P40692 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MLH1P40692 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MLH1P40692 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MLH1P40692 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MLH1P40692 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MLH1P40692 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MLH1P40692 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MLH1P40692 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MLH1P40692 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MLH1P40692 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MLH1P40692 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MLH1P40692 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MLH1P40692 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MLH1P40692 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MLH1P40692 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MLH1P40692 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MLH1P40692 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MLH1P40692 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MLH1P40692 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MLH1P40692 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MLH1P40692 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MLH1P40692 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MLH1P40692 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MLH1P40692 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MLH1P40692 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MLH1P40692 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MLH1P40692 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MLH1P40692 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MLH1P40692 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MLH1P40692 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MLH1P40692 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MLH1P40692 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MLH1P40692 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MLH1P40692 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MLH1P40692 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MLH1P40692 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MLH1P40692 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MLH1P40692 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MLH1P40692 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MLH1P40692 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MLH1P40692 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MLH1P40692 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MLH1P40692 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MLH1P40692 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MLH1P40692 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MLH1P40692 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MLH1P40692 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MLH1P40692 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MLH1P40692 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MLH1P40692 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MLH1P40692 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MLH1P40692 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MLH1P40692 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MLH1P40692 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MLH1P40692 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MLH1P40692 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MLH1P40692 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MLH1P40692 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MLH1P40692 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MLH1P40692 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MLH1P40692 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MLH1P40692 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MLH1P40692 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MLH1P40692 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MLH1P40692 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MLH1P40692 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MLH1P40692 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH1P40692 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH1P40692 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH1P40692 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH1P40692 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH1P40692 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH1P40692 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH1P40692 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH1P40692 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH1P40692 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH1P40692 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH1P40692 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH1P40692 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH1P40692 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH1P40692 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH1P40692 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH1P40692 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH1P40692 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH1P40692 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH1P40692 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH1P40692 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH1P40692 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH1P40692 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH1P40692 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH1P40692 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH1P40692 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH1P40692 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH1P40692 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH1P40692 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH1P40692 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms