Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG3P32926 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG3P32926 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG3P32926 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG3P32926 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG3P32926 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG3P32926 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG3P32926 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG3P32926 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG3P32926 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG3P32926 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG3P32926 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG3P32926 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG3P32926 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG3P32926 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG3P32926 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG3P32926 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG3P32926 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG3P32926 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG3P32926 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG3P32926 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG3P32926 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG3P32926 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG3P32926 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG3P32926 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG3P32926 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG3P32926 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG3P32926 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG3P32926 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG3P32926 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG3P32926 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG3P32926 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSG3P32926 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSG3P32926 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DSG3P32926 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSG3P32926 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSG3P32926 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSG3P32926 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSG3P32926 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSG3P32926 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSG3P32926 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSG3P32926 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSG3P32926 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DSG3P32926 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSG3P32926 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSG3P32926 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSG3P32926 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG3P32926 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG3P32926 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG3P32926 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG3P32926 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG3P32926 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG3P32926 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG3P32926 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG3P32926 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG3P32926 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG3P32926 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG3P32926 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG3P32926 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG3P32926 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG3P32926 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG3P32926 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG3P32926 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG3P32926 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG3P32926 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DSG3P32926 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DSG3P32926 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
DSG3P32926 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DSG3P32926 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSG3P32926 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSG3P32926 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSG3P32926 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSG3P32926 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSG3P32926 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSG3P32926 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSG3P32926 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSG3P32926 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSG3P32926 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms