Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTFRP26992 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms