Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMLP26374 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMLP26374 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMLP26374 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMLP26374 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMLP26374 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMLP26374 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMLP26374 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMLP26374 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMLP26374 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMLP26374 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMLP26374 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMLP26374 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMLP26374 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMLP26374 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMLP26374 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMLP26374 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMLP26374 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMLP26374 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMLP26374 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMLP26374 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMLP26374 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMLP26374 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMLP26374 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMLP26374 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMLP26374 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMLP26374 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMLP26374 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMLP26374 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMLP26374 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMLP26374 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMLP26374 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMLP26374 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMLP26374 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMLP26374 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMLP26374 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHMLP26374 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHMLP26374 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHMLP26374 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHMLP26374 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHMLP26374 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CHMLP26374 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMLP26374 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMLP26374 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMLP26374 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMLP26374 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMLP26374 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMLP26374 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMLP26374 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMLP26374 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMLP26374 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMLP26374 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMLP26374 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMLP26374 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMLP26374 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMLP26374 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMLP26374 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMLP26374 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMLP26374 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMLP26374 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMLP26374 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMLP26374 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMLP26374 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMLP26374 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMLP26374 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMLP26374 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMLP26374 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMLP26374 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMLP26374 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMLP26374 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMLP26374 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMLP26374 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMLP26374 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMLP26374 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMLP26374 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMLP26374 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms