Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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