Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA6P23229 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms