Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NF1P21359 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NF1P21359 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NF1P21359 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NF1P21359 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NF1P21359 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NF1P21359 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NF1P21359 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NF1P21359 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms