Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms