Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms