Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATF4P18848 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATF4P18848 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATF4P18848 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATF4P18848 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATF4P18848 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATF4P18848 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATF4P18848 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATF4P18848 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATF4P18848 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATF4P18848 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATF4P18848 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATF4P18848 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATF4P18848 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATF4P18848 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATF4P18848 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATF4P18848 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATF4P18848 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATF4P18848 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATF4P18848 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATF4P18848 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATF4P18848 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATF4P18848 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATF4P18848 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATF4P18848 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATF4P18848 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATF4P18848 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATF4P18848 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATF4P18848 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATF4P18848 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATF4P18848 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATF4P18848 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATF4P18848 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATF4P18848 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATF4P18848 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATF4P18848 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATF4P18848 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATF4P18848 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATF4P18848 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATF4P18848 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATF4P18848 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATF4P18848 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATF4P18848 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATF4P18848 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATF4P18848 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATF4P18848 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATF4P18848 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATF4P18848 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATF4P18848 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATF4P18848 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATF4P18848 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATF4P18848 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATF4P18848 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATF4P18848 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATF4P18848 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATF4P18848 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATF4P18848 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATF4P18848 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATF4P18848 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATF4P18848 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATF4P18848 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATF4P18848 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATF4P18848 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATF4P18848 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATF4P18848 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATF4P18848 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATF4P18848 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATF4P18848 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms