Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms