Protein–RNA interactions for Protein: P0CB47

UBTFL1, Upstream-binding factor 1-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFL1P0CB47 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBTFL1P0CB47 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBTFL1P0CB47 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBTFL1P0CB47 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBTFL1P0CB47 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBTFL1P0CB47 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBTFL1P0CB47 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBTFL1P0CB47 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBTFL1P0CB47 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBTFL1P0CB47 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBTFL1P0CB47 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms