Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN2P0C2S0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms