Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX7O95931 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX7O95931 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX7O95931 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX7O95931 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX7O95931 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX7O95931 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX7O95931 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX7O95931 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX7O95931 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX7O95931 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX7O95931 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX7O95931 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX7O95931 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX7O95931 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX7O95931 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX7O95931 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX7O95931 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX7O95931 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX7O95931 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX7O95931 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX7O95931 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX7O95931 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX7O95931 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX7O95931 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX7O95931 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX7O95931 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX7O95931 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX7O95931 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX7O95931 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX7O95931 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX7O95931 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX7O95931 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX7O95931 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX7O95931 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX7O95931 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX7O95931 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX7O95931 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX7O95931 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX7O95931 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX7O95931 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX7O95931 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX7O95931 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX7O95931 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX7O95931 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX7O95931 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX7O95931 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX7O95931 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX7O95931 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX7O95931 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX7O95931 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX7O95931 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX7O95931 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX7O95931 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX7O95931 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX7O95931 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX7O95931 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX7O95931 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX7O95931 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX7O95931 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX7O95931 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX7O95931 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX7O95931 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX7O95931 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX7O95931 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX7O95931 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX7O95931 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX7O95931 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX7O95931 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX7O95931 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms