Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms