Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NBNO60934 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NBNO60934 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NBNO60934 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NBNO60934 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NBNO60934 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NBNO60934 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NBNO60934 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NBNO60934 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NBNO60934 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NBNO60934 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NBNO60934 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NBNO60934 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NBNO60934 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NBNO60934 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NBNO60934 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NBNO60934 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NBNO60934 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NBNO60934 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NBNO60934 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NBNO60934 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NBNO60934 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NBNO60934 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NBNO60934 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NBNO60934 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NBNO60934 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NBNO60934 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NBNO60934 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NBNO60934 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NBNO60934 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NBNO60934 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NBNO60934 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NBNO60934 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NBNO60934 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NBNO60934 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NBNO60934 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NBNO60934 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NBNO60934 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NBNO60934 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NBNO60934 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NBNO60934 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NBNO60934 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NBNO60934 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NBNO60934 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NBNO60934 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NBNO60934 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NBNO60934 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NBNO60934 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NBNO60934 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NBNO60934 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NBNO60934 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NBNO60934 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NBNO60934 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NBNO60934 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NBNO60934 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NBNO60934 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NBNO60934 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NBNO60934 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NBNO60934 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NBNO60934 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NBNO60934 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NBNO60934 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NBNO60934 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NBNO60934 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NBNO60934 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NBNO60934 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NBNO60934 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NBNO60934 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NBNO60934 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NBNO60934 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NBNO60934 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NBNO60934 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NBNO60934 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NBNO60934 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NBNO60934 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NBNO60934 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NBNO60934 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NBNO60934 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NBNO60934 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NBNO60934 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NBNO60934 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NBNO60934 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NBNO60934 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NBNO60934 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NBNO60934 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NBNO60934 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NBNO60934 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NBNO60934 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NBNO60934 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NBNO60934 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NBNO60934 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NBNO60934 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NBNO60934 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NBNO60934 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NBNO60934 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NBNO60934 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NBNO60934 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NBNO60934 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NBNO60934 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NBNO60934 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
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