Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B3O60423 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms