Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms