Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms