Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC5O15511 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC5O15511 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms