Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A1O14983 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms