Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms