Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms