Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 GPR19-203ENST00000540510 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 INPP4B-212ENST00000507861 1506 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 PLGLB2-201ENST00000359481 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AL354794.2-201ENST00000424795 1248 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LINC01919-203ENST00000581198 598 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AL162171.3-201ENST00000617439 3178 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms