Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TDRD1Q9BXT4 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TDRD1Q9BXT4 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TDRD1Q9BXT4 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
TDRD1Q9BXT4 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
TDRD1Q9BXT4 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
TDRD1Q9BXT4 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
TDRD1Q9BXT4 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
TDRD1Q9BXT4 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
TDRD1Q9BXT4 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
TDRD1Q9BXT4 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
TDRD1Q9BXT4 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
TDRD1Q9BXT4 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
TDRD1Q9BXT4 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AC093766.1-201ENST00000502606 866 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AP004607.6-201ENST00000525033 1202 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 TAAR2-202ENST00000367931 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 FAM155A-IT1-201ENST00000449551 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD1Q9BXT4 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms