Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AC023161.1-201ENST00000549532 420 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AC073896.2-202ENST00000549860 437 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 DCN-215ENST00000550099 719 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 IQCK-206ENST00000564186 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AMYH02020865.1-207ENST00000617096 458 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 MKX-AS1-201ENST00000412244 745 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AL157698.1-201ENST00000415190 1011 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AL121983.2-201ENST00000426899 688 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AL513303.1-201ENST00000432452 591 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 RPLP0P1-201ENST00000457002 361 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 EIF3EP2-201ENST00000423042 1814 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN25C9JDP6 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms