Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL162231.2-201ENST00000434627 665 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 LINC01762-205ENST00000437308 539 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC133965.1-201ENST00000452984 354 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 MRPL45P2-203ENST00000573318 473 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 C17orf80-208ENST00000582793 531 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL353807.4-201ENST00000604995 257 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 QRSL1P3-201ENST00000552666 1316 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 PTPRD-AS1-201ENST00000430766 1959 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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RTL8BQ17RB0 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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RTL8BQ17RB0 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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RTL8BQ17RB0 AC022167.5-202ENST00000637237 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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