Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 OR4F8P-201ENST00000589943 937 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC093074.1-201ENST00000590280 556 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ZNF675-202ENST00000596211 581 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 DUSP22-216ENST00000605863 551 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC016582.3-206ENST00000636547 207 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC074198.1-201ENST00000506546 1397 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 C1orf131-203ENST00000366651 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 MTA3-201ENST00000405094 1785 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AL021396.1-202ENST00000457707 1929 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 WDR89-204ENST00000620954 2935 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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PDCD1Q15116 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 LIN9-205ENST00000481685 1916 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ATP5A1P10-201ENST00000622403 1603 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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PDCD1Q15116 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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PDCD1Q15116 AC245100.4-203ENST00000635493 1357 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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PDCD1Q15116 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 C1orf54-203ENST00000369102 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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PDCD1Q15116 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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PDCD1Q15116 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AP000880.1-201ENST00000529416 743 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AL133304.1-201ENST00000548199 549 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 BLID-201ENST00000560104 862 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC092133.1-201ENST00000565828 719 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC243312.1-201ENST00000570582 275 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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