Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC079921.2-201ENST00000507579 455 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC040162.2-201ENST00000573092 157 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 ADAMTS9-AS2-202ENST00000474768 2388 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 SAR1A-202ENST00000373238 3227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 MSL3-206ENST00000380693 2377 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 LINC02203-204ENST00000628444 2323 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 TMEM72-AS1-201ENST00000450287 3300 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 UBE2CP1-201ENST00000557130 554 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 HUS1-201ENST00000258774 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 KIF6-208ENST00000538893 2386 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 UBE2D3-204ENST00000349311 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC027319.1-201ENST00000591657 511 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 RGS5-215ENST00000439699 1441 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 ZNF438-202ENST00000361310 3144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 RNA5SP287-201ENST00000516358 103 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms