Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 PHF11-201ENST00000357596 1471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 CSRP1-216ENST00000532460 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 Z83847.1-201ENST00000569912 1463 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 SYPL1-202ENST00000455385 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 PCDH19-201ENST00000255531 7937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 LASP1-204ENST00000435347 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 TMEM169-205ENST00000454545 3460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 ATP8A2-204ENST00000381655 9575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 GBP4-201ENST00000355754 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AL133367.1-201ENST00000568177 4063 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC097374.1-202ENST00000582835 3329 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 PCGF2-207ENST00000620225 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 PLA2G2C-201ENST00000247992 453 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 MYL4-201ENST00000354968 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 SAA1-201ENST00000356524 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 THEM5-201ENST00000368817 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 RPL3P7-201ENST00000417878 1212 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 PIGQP1-201ENST00000426300 430 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 ZNF823-203ENST00000440527 550 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AL590326.1-201ENST00000460857 334 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL118P-201ENST00000580570 302 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC008655.1-201ENST00000595563 457 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 BICRA-AS1-201ENST00000598376 547 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 DRICH1-202ENST00000614553 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC020658.5-201ENST00000622487 442 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 SVIL-202ENST00000375398 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC023300.3-201ENST00000623096 5025 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 MADD-205ENST00000395344 4988 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 CXCR1-201ENST00000295683 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 FAM172A-201ENST00000395965 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 TMEM237-203ENST00000409883 5415 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 TCF4-208ENST00000543082 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 RBMY1E-202ENST00000382658 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 ZNF98-201ENST00000357774 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 ZNF619-203ENST00000432264 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 MORC2-201ENST00000215862 4469 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 NHS-204ENST00000615422 8860 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 SLC16A14-201ENST00000295190 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 TCTN3-201ENST00000265993 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AL139811.2-201ENST00000373465 1630 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 TUBBP1-202ENST00000518096 1646 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 WTAP-202ENST00000358372 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 SLC22A24-202ENST00000417740 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 TP63-209ENST00000437221 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 IAPP-201ENST00000240652 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 ZFP37-202ENST00000553380 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 SCAMP5-201ENST00000361900 3427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 ALAS1-205ENST00000484952 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC004147.2-201ENST00000583224 3753 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 MRPS35-201ENST00000081029 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 POM121L6P-201ENST00000441186 1826 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 SLC13A5-201ENST00000293800 3176 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 P4HA2-203ENST00000379086 2223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 SELENOP-214ENST00000514985 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 SYT6-202ENST00000607941 4352 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 APOL1-201ENST00000319136 3000 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 JADE1-211ENST00000512960 3000 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 RBM44-202ENST00000409864 3449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 SLAMF9-201ENST00000368092 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 LAMTOR2-202ENST00000368304 521 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC000081.1-201ENST00000433141 297 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 TBL1YP1-201ENST00000440297 1026 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 FAM107B-228ENST00000496330 697 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC106795.2-201ENST00000502514 613 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 TMEM208-210ENST00000565201 832 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 ZNF213-AS1-210ENST00000576590 541 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC012447.1-201ENST00000577914 682 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC091027.2-201ENST00000578030 179 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL262P-201ENST00000584590 294 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC010615.2-206ENST00000593653 556 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 CHCHD2P11-201ENST00000604283 457 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AL031281.2-201ENST00000606754 748 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.7 ms