Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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CCDC96Q2M329 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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CCDC96Q2M329 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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CCDC96Q2M329 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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CCDC96Q2M329 AL358394.2-201ENST00000427229 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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CCDC96Q2M329 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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CCDC96Q2M329 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
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CCDC96Q2M329 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 RPL31-202ENST00000409000 641 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
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CCDC96Q2M329 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
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CCDC96Q2M329 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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CCDC96Q2M329 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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CCDC96Q2M329 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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CCDC96Q2M329 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AC084024.1-201ENST00000476186 621 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
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