Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 NOX4-203ENST00000375979 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 FASLG-202ENST00000367721 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
FAM187BQ17R55 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms