Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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CDH18Q13634 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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