Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LINC01096-201ENST00000501050 1263 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC01182-201ENST00000503532 582 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AF279873.3-204ENST00000523336 784 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC092818.1-201ENST00000523411 639 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AP003119.2-201ENST00000528075 336 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 FXYD2-206ENST00000532119 562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC023513.1-201ENST00000604396 691 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL451054.1-201ENST00000621770 772 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 PPP1R1C-202ENST00000409137 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ZNF20-201ENST00000334213 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CCDC66-203ENST00000394672 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 NHEJ1-202ENST00000409720 1954 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 OR2A3P-202ENST00000641249 1776 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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PDCD1Q15116 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 WFDC8-201ENST00000289953 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 RNA5SP18-201ENST00000390935 121 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC092952.1-201ENST00000397646 1209 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 RBBP4P4-201ENST00000398588 1289 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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PDCD1Q15116 U3.31-201ENST00000408113 216 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 GAS8-AS1-201ENST00000408886 435 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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PDCD1Q15116 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 BX322234.2-202ENST00000435612 479 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 LINC01747-201ENST00000437696 1067 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC091730.1-201ENST00000440455 692 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC009970.1-201ENST00000444873 432 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AL031736.1-201ENST00000449688 618 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 RPL7P14-201ENST00000449851 741 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 RN7SL55P-201ENST00000464534 297 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 RN7SL36P-201ENST00000469345 276 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 RN7SL414P-201ENST00000469545 294 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 C1orf112-208ENST00000496973 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 GAPDHP61-201ENST00000507324 1005 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 OR7E83P-201ENST00000511021 970 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 IGLV10-67-201ENST00000519446 325 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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