Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 LINC01919-201ENST00000578610 568 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CCDC152-201ENST00000361970 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ACKR2-201ENST00000422265 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AL136018.1-202ENST00000555300 488 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms