Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC108448.2-201ENST00000431546 730 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CYP4F26P-202ENST00000433357 852 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL138957.1-201ENST00000435156 342 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ACTBP12-201ENST00000435871 418 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ATP5G1P6-201ENST00000451206 412 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL314P-201ENST00000490735 292 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 LINC02517-201ENST00000509453 492 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC023644.1-201ENST00000523380 859 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 SDHCP4-201ENST00000532834 510 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AP003119.1-201ENST00000533437 538 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC006581.1-201ENST00000545706 496 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 MUCL1-202ENST00000546809 439 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC016152.1-201ENST00000548344 521 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL109628.2-201ENST00000554037 201 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 MIR4450-201ENST00000583589 65 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC010320.1-201ENST00000599775 578 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPA1P67-201ENST00000604027 926 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC239803.3-201ENST00000614663 494 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP7-1-201ENST00000621162 721 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 SNHG5-218ENST00000623901 711 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL356095.2-201ENST00000624025 457 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CCDC150-201ENST00000389175 3685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 TIMM21-204ENST00000580087 2524 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ERMARD-205ENST00000418781 1841 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CLRN1-AS1-202ENST00000476886 2223 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RAD9B-207ENST00000409778 1373 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 EGFLAM-AS4-201ENST00000512496 1579 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 LGSN-201ENST00000370657 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 NUDT13-203ENST00000372997 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ATF2-203ENST00000392544 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 HMGCR-202ENST00000343975 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 IGHV4-59-201ENST00000390629 495 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 TMEM199-202ENST00000395404 971 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AKR1B1P8-201ENST00000418396 936 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CENPN-204ENST00000428963 971 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 EMC3-AS1-204ENST00000430621 683 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP9-11P-201ENST00000431013 525 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ASPH-206ENST00000517661 809 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC138761.2-201ENST00000583878 343 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 GMDS-AS1-215ENST00000606884 580 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC016394.1-201ENST00000608444 833 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 FAM30B-201ENST00000611556 397 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.146-201ENST00000619409 286 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC104073.4-201ENST00000632111 598 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC051619.3-201ENST00000560646 2426 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.4 ms