Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 PPP3CB-AS1-214ENST00000620432 654 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AL669830.1-201ENST00000621457 656 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 LINC01194-202ENST00000505877 1319 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 HNRNPCP2-201ENST00000399515 881 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 MKX-AS1-201ENST00000412244 745 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AL049646.2-201ENST00000436848 258 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 RPS10P3-201ENST00000439253 494 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC008026.1-201ENST00000460492 447 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 LINC00881-201ENST00000467995 589 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 RN7SL239P-201ENST00000490061 300 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 OR7E161P-201ENST00000533722 967 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AL157871.5-201ENST00000555212 533 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC027020.1-202ENST00000557839 429 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 CCNT1-206ENST00000640148 596 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 TTC39B-206ENST00000507285 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 OR10A3-201ENST00000360759 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 C6orf106-201ENST00000374021 916 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 APCDD1L-AS1-204ENST00000427794 461 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 PYM1-204ENST00000454792 884 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 ZNF337-AS1-206ENST00000455791 650 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 ADI1P2-201ENST00000514945 429 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AP003084.1-201ENST00000524828 742 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 OVCH1-AS1-202ENST00000550906 654 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC091178.1-204ENST00000577328 366 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AP000436.1-201ENST00000605239 800 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC012560.1-201ENST00000634930 459 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 OR5E1P-201ENST00000305754 927 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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