Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 MYL1-201ENST00000341685 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 HOPX-204ENST00000381260 1141 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 PDE4DIP-241ENST00000616206 874 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 OR7D4-201ENST00000308682 1022 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC091492.1-201ENST00000419844 272 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 BACH1-IT2-201ENST00000436529 806 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 C8orf44-205ENST00000521889 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LINC01146-206ENST00000556684 361 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 SPANXN2-201ENST00000598475 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms