Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 MBNL3-203ENST00000370849 1444 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 IL20-203ENST00000391930 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 OR5AC1-201ENST00000429239 925 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RPS4XP19-201ENST00000460237 736 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC073896.2-202ENST00000549860 437 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC018946.1-201ENST00000560578 458 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 FAM30C-201ENST00000561158 410 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC024451.4-201ENST00000602578 752 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 DIMT1P1-201ENST00000603970 763 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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RTL8BQ17RB0 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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RTL8BQ17RB0 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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RTL8BQ17RB0 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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RTL8BQ17RB0 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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RTL8BQ17RB0 AC083973.1-201ENST00000523459 590 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ARL17A-205ENST00000573185 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AL596325.2-201ENST00000609669 505 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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