Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 SNORD46-201ENST00000364043 104 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 C9orf92-202ENST00000380685 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 GPX2-201ENST00000389614 990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AAMDC-202ENST00000393427 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OR7E36P-201ENST00000419933 954 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC231532.1-201ENST00000438584 312 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL121885.2-201ENST00000440255 819 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC002553.1-201ENST00000442828 802 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 FO393419.1-201ENST00000443746 355 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL390026.1-201ENST00000456647 457 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 FAM74A1-201ENST00000465257 623 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPL12P40-201ENST00000467028 488 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC018816.1-206ENST00000474544 455 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC022296.2-201ENST00000512424 202 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RN7SKP105-201ENST00000517192 314 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC022182.1-202ENST00000529234 580 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AP004833.3-201ENST00000531893 322 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MIR5705-201ENST00000579870 89 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MIR4786-201ENST00000583954 80 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC129492.5-201ENST00000603489 315 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC012488.1-201ENST00000611221 640 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 PPP3CB-AS1-214ENST00000620432 654 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL138924.1-201ENST00000629067 415 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC01173-201ENST00000629370 331 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC063952.4-201ENST00000634744 825 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 GOSR2-222ENST00000639031 885 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC116631.1-202ENST00000640984 683 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MORC1-202ENST00000483760 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CCNC-204ENST00000482541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 HIST1H4E-201ENST00000615164 1487 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CWC15-201ENST00000279839 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AMELY-201ENST00000215479 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 SP140-202ENST00000373645 814 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 NHP2P2-201ENST00000396362 460 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MAML3-201ENST00000398940 831 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 IGKV1OR2-3-201ENST00000411475 288 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC093642.1-201ENST00000412193 565 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC01811-202ENST00000424786 787 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 FTH1P5-201ENST00000425761 545 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
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