Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 BLNK-203ENST00000413476 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 PTMAP1-205ENST00000455552 325 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 ULK4P2-202ENST00000564187 492 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
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HOXD12P35452 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 CYP19A1-216ENST00000559878 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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HOXD12P35452 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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HOXD12P35452 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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HOXD12P35452 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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HOXD12P35452 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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HOXD12P35452 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 RPL34P19-201ENST00000415903 342 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 DPP10-AS1-202ENST00000448663 644 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 RN7SL180P-201ENST00000466769 294 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 PPP1R2P6-201ENST00000478565 588 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 ABHD10-204ENST00000494817 801 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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