Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL049829.3-202ENST00000604278 711 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC073857.1-201ENST00000625082 1054 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AL353747.4-202ENST00000625787 674 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 EEF1A1P28-201ENST00000450915 1403 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC126615.1-201ENST00000470084 630 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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RTL8BQ17RB0 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 HNRNPCP8-201ENST00000528764 888 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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RTL8BQ17RB0 DCTN5-204ENST00000563998 878 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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RTL8BQ17RB0 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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RTL8BQ17RB0 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 LINC01232-204ENST00000626729 2796 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CDY2B-202ENST00000544303 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 DLD-205ENST00000440410 1993 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 PAGE4-201ENST00000218068 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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