Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC133965.1-201ENST00000452984 354 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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CDH18Q13634 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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CDH18Q13634 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC125603.4-201ENST00000621942 2699 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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